北京现代瑞纳变速箱采用5速手动和4速自动变速箱，为国产变速箱。变速箱配置上，瑞纳采用的4AT变速箱，虽然挡位不多，但是胜在换挡平顺行车质感不错。

这台变速箱尽力的工作让人挑不出什么毛病，一般正常驾驶情况下你只会轻微感觉到它在提升或降低挡位，就算是需要它降挡提速而突然深踩油门，也无需等待多时便能立刻做出反应。